Expression patterns and action analysis of genes associated with drug-induced liver diseases during rat liver regeneration

Table 1 Expression abundance of 32 genes associated with drug-induced liver diseases during liver regeneration

Gene	Recovery time (h) after partial hepatectomy (PH)
Abbr.	0	0.5	1	2	4	6	8	12	16	18	24	30	36	42	48	54	60	66	72	96	120	144	168
1 Cholestasis
Ace	1	0.80	0.48	1.29	0.88	1.39	0.82	1.14	1.16	1.00	0.88	0.93	1.18	1.03	1.18	1.03	1.39	0.56	0.71	0.78	0.75	0.56	0.47
Akt1	1	0.81	0.76	0.98	0.86	1.01	0.87	1.11	1.12	0.62	0.71	3.91	0.65	2.60	0.53	0.57	0.68	1.10	0.97	1.17	1.02	0.94	1.01
Apoe	1	0.93	1.24	0.87	0.93	1.07	0.95	0.76	0.15	0.93	1.08	0.13	0.93	0.17	1.00	1.00	0.93	1.07	1.20	0.33	1.41	1.23	1.07
Bdnf	1	0.97	0.46	1.98	1.43	1.04	1.04	2.00	2.08	0.63	0.58	2.12	0.52	1.43	0.45	1.25	2.50	1.06	1.32	2.56	0.39	0.52	0.50
Cyp2d6	1	0.76	0.33	1.62	1.00	1.15	1.35	1.62	1.14	1.15	1.24	0.60	0.57	0.74	0.81	0.81	0.66	1.73	0.65	1.07	0.66	0.44	0.50
Ephx1	1	1.52	1.53	1.32	0.93	1.00	0.63	0.41	0.86	0.76	0.62	0.97	2.46	1.12	2.14	1.74	2.00	2.82	2.77	0.54	1.74	1.62	1.62
Il6	1	1.87	1.08	3.25	3.25	3.03	3.81	1.32	0.99	3.25	1.87	0.91	0.50	1.28	2.83	1.87	2.30	0.87	0.28	6.06	0.81	1.52	0.93
Mmp9	1	2.05	2.16	2.10	2.07	1.37	2.81	2.75	2.13	1.12	1.58	1.27	1.83	5.89	1.00	1.20	1.15	1.16	1.21	9.54	2.22	0.48	2.03
Slc22a1	1	0.62	0.88	0.76	0.66	0.66	0.59	0.71	0.86	0.81	0.82	1.20	0.71	1.47	0.41	0.71	0.62	1.31	1.05	1.23	0.81	0.76	0.71
Slc22a2	1	1.23	1.01	0.50	0.93	0.87	0.39	0.38	0.33	0.38	0.33	0.08	0.87	0.69	1.07	1.07	1.62	0.18	0.98	0.38	0.66	1.15	1.32
2 Fatty liver
Esr1	1	1.07	0.62	3.48	4.92	4.92	1.17	1.41	1.31	2.14	1.08	1.29	1.23	1.37	1.74	2.64	4.29	1.51	1.48	1.23	4.59	6.06	2.30
Fabp1	1	0.87	1.16	0.81	0.81	1.00	0.77	0.66	1.40	0.87	0.94	1.29	0.87	1.12	0.87	0.93	0.93	1.07	1.29	0.50	1.23	1.00	0.93
Hiat1	1	0.93	1.43	1.07	1.07	1.32	1.90	1.15	1.14	1.15	1.33	0.10	1.00	0.14	1.41	1.07	0.93	1.41	1.20	0.15	1.32	1.32	1.32
Hsd11b1	1	4.92	6.13	2.64	4.92	2.83	3.81	1.07	0.99	2.14	3.50	1.04	0.87	0.97	2.83	1.87	2.46	0.93	2.77	0.93	3.73	5.28	4.92
Il5	1	1.15	0.67	1.00	0.76	0.76	1.26	1.52	0.86	2.83	1.52	0.85	1.32	1.28	3.03	3.25	3.48	1.51	1.70	1.07	0.93	1.32	1.32
Mthfr	1	0.47	0.44	1.87	3.25	2.64	3.19	3.73	1.50	0.50	0.38	1.48	0.66	1.69	0.66	0.71	0.87	0.46	0.40	2.00	0.57	0.66	0.50
Tnf	1	0.87	0.62	1.23	1.41	1.15	1.17	0.93	0.93	0.71	0.66	0.79	1.41	0.85	1.62	1.07	1.15	0.93	0.52	1.23	3.25	0.81	0.71
Trp63	1	3.00	2.44	2.40	1.06	0.97	1.70	2.03	1.58	1.81	1.35	0.84	1.19	1.33	1.55	2.12	1.62	1.23	1.12	1.11	0.74	1.19	0.90
Ugt1a1	1	0.93	1.43	1.28	1.23	1.15	0.99	0.71	2.06	1.04	0.88	1.36	1.04	1.25	0.95	0.95	1.08	1.51	1.34	0.69	1.42	1.12	1.08
3 Liver ischemic injury
Ces2	1	0.81	1.08	1.32	1.32	1.23	1.44	1.00	2.81	1.23	1.42	0.85	1.62	2.23	1.74	1.62	1.52	3.24	2.77	1.23	1.87	1.41	1.52
Ces3	1	1.74	3.29	2.46	3.03	3.03	2.88	1.32	0.70	0.87	1.00	0.64	0.44	0.60	0.27	0.44	0.57	0.33	1.48	0.71	1.23	1.62	1.62
Creb1	1	0.93	1.01	0.93	0.50	1.00	0.55	0.66	1.06	1.23	0.94	0.91	0.87	0.91	0.87	1.41	1.15	1.14	0.85	0.93	1.23	1.07	1.00
Fos	1	28.43	16.11	8.54	3.07	4.82	2.07	3.72	3.50	2.83	2.63	3.21	1.77	2.03	2.76	1.65	1.69	1.90	1.71	1.12	2.44	0.88	1.00
Per1	1	3.03	3.49	4.29	3.91	3.73	3.09	0.93	1.61	0.38	0.71	1.38	0.44	1.81	0.44	0.33	0.47	0.75	0.79	1.15	3.48	4.00	3.48
4 Drug hepatitis
Bcl2	1	0.82	0.64	1.12	1.00	1.19	1.17	1.15	0.85	0.33	0.37	1.80	0.32	0.79	0.44	0.39	0.46	0.81	0.38	0.84	0.50	0.68	0.64
Cyp2d6	1	0.76	0.33	1.62	1.00	1.15	1.35	1.62	1.14	1.15	1.24	0.60	0.57	0.74	0.81	0.81	0.66	1.73	0.65	1.07	0.66	0.44	0.50
Egr1	1	17.15	18.59	13.93	2.30	2.00	2.68	3.48	0.86	1.62	2.84	0.64	3.03	0.56	2.83	3.25	3.73	4.58	2.25	0.66	3.03	1.00	0.93
Esr1	1	1.07	0.62	3.48	4.92	4.92	1.17	1.41	1.31	2.14	1.08	1.29	1.23	1.37	1.74	2.64	4.29	1.51	1.48	1.23	4.59	6.06	2.30
Gstm1	1	1.32	2.17	1.32	1.52	1.52	1.26	0.66	1.61	1.23	1.42	1.12	1.23	1.69	1.41	1.52	1.52	1.73	2.10	1.07	1.62	1.52	1.32
Il5	1	1.15	0.67	1.00	0.76	0.76	1.26	1.52	0.86	2.83	1.52	0.85	1.32	1.28	3.03	3.25	3.48	1.51	1.70	1.07	0.93	1.32	1.32
Mthfr	1	0.47	0.44	1.87	3.25	2.64	3.19	3.73	1.50	0.50	0.38	1.48	0.66	1.69	0.66	0.71	0.87	0.46	0.40	2.00	0.57	0.66	0.50
Nat2	1	1.00	1.89	1.07	2.30	1.32	1.09	1.41	0.99	3.25	4.02	1.29	1.07	1.04	3.48	2.83	3.25	2.63	1.70	1.41	3.48	1.74	2.46
Pten	1	0.66	1.08	0.93	0.50	0.47	0.72	0.76	0.86	1.23	1.33	0.79	1.41	1.04	1.74	1.32	1.23	1.62	1.12	1.41	1.52	1.32	1.23
Ptgs2	1	0.57	0.90	2.14	1.23	1.41	1.17	1.41	1.31	0.62	0.66	0.85	0.12	1.12	0.47	0.71	1.15	0.31	0.69	1.00	0.44	0.33	0.47
Trp63	1	3.00	2.44	2.40	1.06	0.97	1.70	2.03	1.58	1.81	1.35	0.84	1.19	1.33	1.55	2.12	1.62	1.23	1.12	1.11	0.74	1.19	0.90
5 Granulomatous disease of the liver
Cyp2d6	1	0.76	0.33	1.62	1.00	1.15	1.35	1.62	1.14	1.15	1.24	0.60	0.57	0.74	0.81	0.81	0.66	1.73	0.65	1.07	0.66	0.44	0.50
6 Peliosis hepatis
Erbb2	1	0.50	0.10	1.74	0.66	0.62	0.34	0.62	1.40	0.29	0.17	1.12	0.41	1.47	0.50	0.41	0.47	0.15	0.15	1.15	0.25	0.23	0.31
Sult1a1	1	1.62	2.17	1.41	1.52	1.41	1.26	0.76	0.22	1.00	1.24	1.12	1.15	0.49	1.87	1.32	1.41	1.62	1.70	0.71	1.74	1.62	1.62

Italic numbers: Genes are up-regulated more than twofold; Bold numbers: Genes are down-regulated more than twofold.