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世界华人消化杂志. 2016-06-08; 24(16): 2485-2491
Published online 2016-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v24.i16.2485
Published online 2016-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v24.i16.2485
慢性乙型肝炎患者的差异表达基因筛选及相关信号通路预测
宁文锋, 王芳, 邓宏军, 陈宏辉, 南华大学附属第二医院消化内科 湖南省衡阳市 421001
宁文锋, 副主任医师, 主要从事消化系统疾病的研究.
作者贡献分布: 宁文锋与王芳对此文所作贡献均等; 此课题由宁文锋与陈宏辉设计; 研究过程由宁文锋与王芳操作完成; 数据分析由宁文锋、王芳及邓宏军完成; 本论文写作由宁文锋与王芳完成.
通讯作者: 陈宏辉, 主任医师, 421001, 湖南省衡阳市蒸湘区解放大道35号, 南华大学附属第二医院消化内科. chhhhcchh@sina.com.cn
电话: 0374-8899880
收稿日期: 2016-03-27
修回日期: 2016-04-19
接受日期: 2016-04-23
在线出版日期: 2016-06-08
修回日期: 2016-04-19
接受日期: 2016-04-23
在线出版日期: 2016-06-08
Abstract
目的: 研究慢性乙型肝炎发病的分子机制.
方法: 通过基因表达谱芯片, 运用GeneSpring软件筛选慢性乙型肝炎患者的差异表达基因; 运用GeneTrail软件, 对差异表达基因进行信号通路富集分析.
结果: 发现417个差异表达基因, 其中表达上调的基因数目为205个, 表达下调的基因数目为212个; 下调基因的显著性信号通路为ErbB、非小细胞肺癌、mTOR、RNA降解、T细胞受体、慢性粒细胞白血病、肾细胞癌信号通路, 上调基因的显著性信号通路为趋化因子、溶酶体、霍乱弧菌感染、IgG Fc受体介导的吞噬作用信号通路.
结论: PI3K/AKT下调可能是乙型肝炎患者持续感染的主要分子机制之一.
Keywords: 慢性乙型肝炎; 基因芯片; 差异表达基因; 信号通路
核心提示: 使用基因芯片及生物信息学分析等方法研究慢性乙型肝炎的发病分子机制, 提出PI3K/AKT下调可能是乙型肝炎病毒患者持续感染的主要分子机制之一. 差异表达基因PTPRC与T细胞功能是乙型肝炎患者分子免疫机制研究的新方向之一.