Rapid Communication
Copyright ©2006 Baishideng Publishing Group Co.
World J Gastroenterol. Feb 28, 2006; 12(8): 1308-1311
Published online Feb 28, 2006. doi: 10.3748/wjg.v12.i8.1308
Table 1 Primers and probe used in universal RT-PCR
Primers or probeSequence
Reverse primers
Reaction V5’-CCCCCAATACCACATCATCC-3’
Reaction I5’-CCCCCAATACCACATCATCA-3’
Reaction C5’-CCCCCAATACCACATCATC-3’
Forward primers5’-tgaggagcacgagacggaagtATACAA CACCTGTATTCCCATCCCAT-3’
Probe5’-FAM ACTTCCGTCTCGTGCTCCTCA TAMRA-3’
Table 2 Comparison of results obtained by real-time PCR and sequencing
SamplesHBV DNA(Copies/mL)Result of UT-PCRResult of sequencing
12.49 × 105YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
24.73 × 107YIDD5′ -TATATTGATGAT-3′
36.10 × 103YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
46.24 × 106YIDD5′ -TATATTGATGAT-3′
52.98 × 109YIDD5′ -TATATTGATGAT-3′
68.13 × 106YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
71.35 × 104YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
83.57 × 103YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
92.74 × 106YVDD5′ -TATGTGGATGAT-3′
109.10 × 104YVDD5′ -TATGTGGATGAT-3′
117.02 × 104YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
125.18 × 105YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
133.51 × 103YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
148.04 × 104YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′
154.29 × 106YMDD5′ -TATATGGATGAT-3′